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Differences in the microbial communities associated with roots of different cultivars of canola and wheat

Par Conseil national de recherches du Canada

DOITrouver le DOI : https://doi.org/10.1139/w98-075
AuteurRechercher : ; Rechercher : ; Rechercher : ; Rechercher : ; Rechercher :
FormatTexte, Article
SujetBrassica spp.; Triticum spp.; rhizosphere; endophytes; FAME; Biolog™; Brassica spp.; Triticum spp.; rhizosphère; endophytes; FAME; Biolog™; transgénique
Résumé
On sait que les caractéristiques des plantes peuvent influencer les populations microbiennes endophytes et de la rhizosphère mais l’effet des programmes d’amélioration des récoltes sur ces populations n’est pas clair. Le but de la présente étude a été de vérifier si les populations microbiennes associées aux racines différaient entre trois cultivars de canola (Brassica spp.) et de blé (Triticum spp.). L’analyse Biolog™ a permis de caractériser les populations microbiennes présentes à l’intérieur des racines et dans le sol de la rhizosphère de plants de canola (cultivars Parkland, Excel et Quest) et de blé (cultivars PI 167549, Red Fife et CDC Teal) cultivés au champ. Les profils des acides gras méthylestérifiés (FAME) des cultivars des racines et du sol de la rhizosphère ont aussi été comparés. Ces cultivars représentent un continuum entre les plus anciens et les plus récents cultivars pour les récoltes, Quest étant une variété de canola tolérante à l’herbicide glyphosate. Au meilleur de notre connaissance, le cultivar Quest n’était pas directement apparenté à Parkland ou à Excel. La population endophyte de Quest utilisait les polymères, les hydrates de carbone, les acides aminés et divers mélanges fonctionnels Biolog™ à un taux plus lent que la population endophyte d’Excel ou de Parkland. On a aussi noté des niveaux plus faibles des FAMEs microbiens 18:0, 18:3 w6c (6,9,12), 16:0 2OH et 15:0 2OH dans les racines de Quest comparativement à Excel et Parkland. Par contre, il n’y avait pas de différence dans le taux d’utilisation des mélanges fonctionnels Biolog™ ou des FAMEs microbiens dans les racines des trois cultivars de blé étudiés. La capacité des populations endophytes et de la rhizosphère à utiliser les substrats Biolog™ était plus faible chez Quest et CDC Teal comparativement aux cultivars plus anciens. Nos résultats confirment que les populations microbiennes endophytes et de la rhizosphère du cultivar transgénique Quest étaient différentes des cultivars non transgéniques cultivés au même site au champ.
Date de publication
Dans
  • Canadian Journal of Microbiology 44, nº 9 (septembre 1998) : 844–851.
Langueanglais
Publication du CNRC
Cette publication n’est pas du CNRC

Ce sont des publications qui ont été rédigées par un auteur du CNRC, mais avant que celui-ci soit employé du CNRC.

Numéro du CNRC41814
Numéro NPARC3538738
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Identificateur de l’enregistremente34608d6-4c50-4d00-871a-988d65ec20e8
Enregistrement créé2009-03-01
Enregistrement modifié2020-03-20
Date de modification :