| Téléchargement | - Voir le manuscrit accepté : The Brassica oleracea genome reveals the asymmetrical evolution of polyploid genomes (PDF, 4.6 Mio)
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| DOI | Trouver le DOI : https://doi.org/10.1038/ncomms4930 |
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| Auteur | Rechercher : Liu, Shengyi; Rechercher : Liu, Yumei; Rechercher : Yang, Xinhua; Rechercher : Tong, Chaobo; Rechercher : Edwards, David; Rechercher : Parkin, Isobel A. P.; Rechercher : Zhao, Meixia; Rechercher : Ma, Jianxin; Rechercher : Yu, Jingyin; Rechercher : Huang, Shunmou; Rechercher : Wang, Xiyin; Rechercher : Wang, Junyi; Rechercher : Lu, Kun; Rechercher : Fang, Zhiyuan; Rechercher : Bancroft, Ian; Rechercher : Yang, Tae-Jin; Rechercher : Hu, Qiong; Rechercher : Wang, Xinfa; Rechercher : Yue, Zhen; Rechercher : Li, Haojie; Rechercher : Yang, Linfeng; Rechercher : Wu, Jian; Rechercher : Zhou, Qing; Rechercher : Wang, Wanxin; Rechercher : King, Graham J.; Rechercher : Pires, J. Chris; Rechercher : Lu, Changxin; Rechercher : Wu, Zhangyan; Rechercher : Sampath, Perumal; Rechercher : Wang, Zhuo; Rechercher : Guo, Hui; Rechercher : Pan, Shengkai; Rechercher : Yang, Limei; Rechercher : Min, Jiumeng; Rechercher : Zhang, Dong; Rechercher : Jin, Dianchuan; Rechercher : Li, Wanshun; Rechercher : Belcram, Harry; Rechercher : Tu, Jinxing; Rechercher : Guan, Mei; Rechercher : Qi, Cunkou; Rechercher : Du, Dezhi; Rechercher : Li, Jiana; Rechercher : Jiang, Liangcai; Rechercher : Batley, Jacqueline; Rechercher : Sharpe, Andrew G.1; Rechercher : Park, Beom-Seok; Rechercher : Ruperao, Pradeep; Rechercher : Cheng, Feng; Rechercher : Waminal, Nomar Espinosa; Rechercher : Huang, Yin; Rechercher : Dong, Caihua; Rechercher : Wang, Li; Rechercher : Li, Jingping; Rechercher : Hu, Zhiyong; Rechercher : Zhuang, Mu; Rechercher : Huang, Yi; Rechercher : Huang, Junyan; Rechercher : Shi, Jiaqin; Rechercher : Mei, Desheng; Rechercher : Liu, Jing; Rechercher : Lee, Tae-Ho; Rechercher : Wang, Jinpeng; Rechercher : Jin, Huizhe; Rechercher : Li, Zaiyun; Rechercher : Li, Xun; Rechercher : Zhang, Jiefu; Rechercher : Xiao, Lu; Rechercher : Zhou, Yongming; Rechercher : Liu, Zhongsong; Rechercher : Liu, Xuequn; Rechercher : Qin, Rui; Rechercher : Tang, Xu; Rechercher : Liu, Wenbin; Rechercher : Wang, Yupeng; Rechercher : Zhang, Yangyong; Rechercher : Lee, Jonghoon; Rechercher : Kim, Hyun Hee; Rechercher : Denoeud, France; Rechercher : Xu, Xun; Rechercher : Liang, Xinming; Rechercher : Hua, Wei; Rechercher : Wang, Xiaowu; Rechercher : Wang, Jun; Rechercher : Chalhoub, Boulos; Rechercher : Paterson, Andrew H. |
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| Affiliation | - Conseil national de recherches du Canada. Développement des cultures et des ressources aquatiques
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| Format | Texte, Article |
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| Sujet | alternative RNA splicing; Brassica oleracea; broccoli; cabbage; cauliflower; gene expression; gene loss; gene sequence; genetic variability; genome; genomics; polyploidy; transposon |
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| Résumé | Polyploidization has provided much genetic variation for plant adaptive evolution, but the mechanisms by which the molecular evolution of polyploid genomes establishes genetic architecture underlying species differentiation are unclear. Brassica is an ideal model to increase knowledge of polyploid evolution. Here we describe a draft genome sequence of Brassica oleracea, comparing it with that of its sister species B. rapa to reveal numerous chromosome rearrangements and asymmetrical gene loss in duplicated genomic blocks, asymmetrical amplification of transposable elements, differential gene co-retention for specific pathways and variation in gene expression, including alternative splicing, among a large number of paralogous and orthologous genes. Genes related to the production of anticancer phytochemicals and morphological variations illustrate consequences of genome duplication and gene divergence, imparting biochemical and morphological variation to B. oleracea. This study provides insights into Brassica genome evolution and will underpin research into the many important crops in this genus. |
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| Date de publication | 2014-05-23 |
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| Dans | |
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| Langue | anglais |
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| Publications évaluées par des pairs | Oui |
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| Numéro du CNRC | NRC-ACRD-56002 |
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| Numéro NPARC | 21272678 |
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| Exporter la notice | Exporter en format RIS |
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| Identificateur de l’enregistrement | e9e56c8b-4a48-48ff-b5fe-257bb18c1ab0 |
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| Enregistrement créé | 2014-12-03 |
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| Enregistrement modifié | 2020-06-04 |
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