| Résumé | On discute de la fréquence de la bande dite « amide I » (vibration d'élongation C=O de l'amide, vC=O) des protéines en fonction des angles dièdres de diverses structures secondaires présentes dans les protéines. On suggère que, dans les cas de groupes carbonyles d'amides impliqués dans des liaisons intra- ou intermoléculaires, la fréquence de cette absorption peut être reliée directement avec les angles Φ et ψ des portions amides des structures secondaires principales. Les bandes amide I observées à des fréquences situées au-dessus de celles que l'on retrouve pour des groupes carbonyles d'amides qui ne sont pas impliqués dans des liaisons hydrogènes peuvent être rationalisées en fonction d'un changement du troisième angle dièdre, ω. On s'attend à ce que des rotations autour de la liaison amide C—N dans des structures implicant de fortes demandes stériques, comme dans les cas où ω s'éloigne de 180°, vont provoquer une augmentation dans la densité électronique des groupes carbonyles des amides et par la suite une augmentation de vC=O vers des fréquences plus élevées que celles observées avec des groupes carbonyles non-pertubés. |
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