High density genetic mapping of stripe rust resistance in a ‘Strongfield’ / ‘Blackbird’ durum wheat population

Par Conseil national de recherches du Canada

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DOI	Trouver le DOI : https://doi.org/10.1080/07060661.2021.1968036
Auteur	Rechercher : Bokore, Firdissa E.Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1073-9816; Rechercher : Ruan, Yuefeng; Rechercher : Mccartney, Curt; Rechercher : Knox, Ron E.Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2030-3899; Rechercher : Pei, Xiangyu; Rechercher : Aboukhaddour, Reem; Rechercher : Randhawa, Harpinder; Rechercher : Ammar, Karim; Rechercher : Meyer, Brad; Rechercher : Cuthbert, Richard D.; Rechercher : Berraies, Samia; Rechercher : Depauw, Ron; Rechercher : Fobert, Pierre¹Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0001-9397-7539
Affiliation	Conseil national de recherches du Canada. Développement des cultures et des ressources aquatiques
Format	Texte, Article
Sujet	blé dur; cartographie des QTL; résistance; marqueurs SNP; rouille jaune
Résumé	La sélection pour la résistance est une stratégie efficace contre la rouille (jaune) causée par Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst). Pour identifier et cartographier les locus à caractère quantitatif (QTL) associés à la résistance à la rouille, une population dihaploïde de blé dur (n = 87) dérivée de ‘Strongfield/Blackbird’ a été évaluée pour la gravité de la maladie près de Toluca, au Mexique (2017 à 2019), et de Lethbridge, au Canada (2016 à 2019). La population a été génotypée avec la puce Illumina iSelect 90K de polymorphisme à nucléotide simple (SNP) et des marqueurs à séquences répétitives simples (SSR), puis on a procédé à l’analyse QTL avec MapQTL 6. Nous avons identifié le QTL de résistance à la rouille fourni par ‘Blackbird’ sur les chromosomes 3A (2 locus, désignés QYr.spa-3A.1, QYr.spa-3A.2) et 5B (QYr.spa-5B), et par ‘Strongfield’ sur 2B (QYr.spa-2B). Tous semblent représenter des QTL jamais rapportés auparavant. Le locus QYr.spa-3A.2 était le plus constamment efficace contre les races de Pst dans les pépinières de Lethbridge et de Toluca. Avec un LOD score de 4,9, QYr.spa-3A.2 expliquait un maximum de 22,7% de variations génotypiques à la pépinière de Toluca en 2019. Le locus QYr.spa-2B de ‘Strongfield’ et le QYr.spa-3A.1 de ‘Blackbird’ se sont exprimés depuis plusieurs années à Toluca, mais n’ont pas été détectés à Lethbridge. QYr.spa-5B a été identifié dans l’environnement de Lethbridge de 2016. Le QTL identifié devrait être utile pour diversifier les gènes de résistance utilisés pour sélectionner les cultivars de blé dur résistants à la rouille. ‘Blackbird’ a été particulièrement utile pour introduire la nouvelle résistance basée sur le QTL QYr.spa-3A.2 qui est efficace au Canada et au Mexique dans les germoplasmes de blés durs traditionnels. Les marqueurs SNP associés au QTL serviront à la sélection assistée par marqueurs pour la résistance à Pst chez le blé dur.
Date de publication	2021-09-28
Maison d’édition	Informa UK Limited Taylor & Francis Group
Licence	Creative Commons, Attribution 4.0 Générique (CC BY 4.0) https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.fr
Dans	Canadian Journal of Plant Pathology (28 septembre 2021) : 1–14.
Langue	anglais
Publications évaluées par des pairs	Oui
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Identificateur de l’enregistrement	dd1380f7-e8d7-4a90-a5d8-e6468100b812
Enregistrement créé	2021-10-15
Enregistrement modifié	2021-10-15

Date de modification :: 2024-04-18