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| DOI | Trouver le DOI : https://doi.org/10.1038/s41467-025-64046-1 |
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| Auteur | Rechercher : White, BenjamenIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-4391-3945; Rechercher : Lux, ThomasIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5543-1911; Rechercher : Rusholme-Pilcher, RachelIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-0000-0038; Rechercher : Juhász, AngélaIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4317-2027; Rechercher : Kaithakottil, GemyIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-1360-7808; Rechercher : Duncan, SusanIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0001-9581-1145; Rechercher : Simmonds, JamesIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-4936-1694; Rechercher : Rees, Hannah; Rechercher : Wright, JonathanIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0001-6471-8749; Rechercher : Colmer, Joshua; Rechercher : Ward, Sabrina; Rechercher : Joynson, Ryan; Rechercher : Coombes, BenedictIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-4956-1055; Rechercher : Irish, Naomi; Rechercher : Henderson, Suzanne; Rechercher : Barker, Tom; Rechercher : Chapman, Helen; Rechercher : Catchpole, Leah; Rechercher : Gharbi, KarimIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-1092-4488; Rechercher : Bose, Utpal; Rechercher : Okada, MoekoIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4398-5917; Rechercher : Handa, Hirokazu; Rechercher : Nasuda, Shuhei; Rechercher : Shimizu, Kentaro K.; Rechercher : Gundlach, HeidrunIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6757-0943; Rechercher : Lang, DanielIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2166-0716; Rechercher : Naamati, Guy; Rechercher : Legg, Erik J.; Rechercher : Bharti, Arvind K.; Rechercher : Colgrave, Michelle L.Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8463-805X; Rechercher : Haerty, WilfriedIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-0111-191X; Rechercher : Uauy, CristobalIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9814-1770; Rechercher : Swarbreck, DavidIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5453-1013; Rechercher : Borrill, PhilippaIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7623-8256; Rechercher : Poland, Jesse A.Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7856-1399; Rechercher : Krattinger, Simon G.; Rechercher : Stein, NilsIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-3011-8731; Rechercher : Mayer, Klaus F. X.Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0001-6484-1077; Rechercher : Pozniak, CurtisIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7536-3856; Rechercher : Walkowiak, Sean; Rechercher : Klymiuk, Valentyna; Rechercher : Byrns, Brook; Rechercher : Nilsen, Kirby; Rechercher : Ens, Jennifer; Rechercher : Wiebe, Krystalee; Rechercher : N’Diaye, Amidou; Rechercher : Hucl, Pierre J.; Rechercher : Pozniak, Curtis J.; Rechercher : Fu, Bin Xiao; Rechercher : Gao, Liangliang; Rechercher : Delorean, Emily; Rechercher : Koo, Dal-Hoe; Rechercher : Fritz, Allen K.; Rechercher : Poland, Jesse; Rechercher : Monat, Cecile; Rechercher : Himmelbach, Axel; Rechercher : Fiebig, Anne; Rechercher : Padmarasu, Sudharsan; Rechercher : Scholz, Uwe; Rechercher : Mascher, Martin; Rechercher : Haberer, Georg; Rechercher : Kassa, Mulualem T.1; Rechercher : Fobert, Pierre1Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0001-9397-7539; Rechercher : Kagale, Sateesh1Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7213-1590; Rechercher : Brinton, Jemima; Rechercher : Ramirez-Gonzalez, Ricardo H.; Rechercher : Bevan, Michael; Rechercher : McKenzie, Neil; Rechercher : Steuernagel, Burkhard; Rechercher : Kolodziej, Markus C.; Rechercher : Krattinger, Simon G.; Rechercher : Keller, Beat; Rechercher : Wicker, Thomas; Rechercher : Thambugala, Dinushika; Rechercher : McCartney, Curt A.; Rechercher : Bandi, Venkat; Rechercher : Siri, Jorge Nunez; Rechercher : Gutwin, Carl; Rechercher : Aquino, Catharine; Rechercher : Hatakeyama, Masaomi; Rechercher : Copetti, Dario; Rechercher : Halstead-Nussloch, Gwyneth; Rechercher : Paape, Timothy; Rechercher : Shimizu-Inatsugi, Rie; Rechercher : Shimizu, Kentaro K.; Rechercher : Ban, Tomohiro; Rechercher : Kawaura, Kanako; Rechercher : Tameshige, Toshiaki; Rechercher : Tsuji, Hiroyuki; Rechercher : Venturini, Luca; Rechercher : Clark, Matthew; Rechercher : Clavijo, Bernardo; Rechercher : Fosker, Christine; Rechercher : Accinelli, Gonzalo Garcia; Rechercher : Heavens, Darren; Rechercher : Krasileva, Ksenia; Rechercher : Gardner, Keith A.; Rechercher : Fradgley, Nick; Rechercher : Percival-Alwyn, Lawrence; Rechercher : Cockram, James; Rechercher : Gutierrez-Gonzalez, Juan; Rechercher : Muehlbauer, Gary; Rechercher : Koh, Chu Shin; Rechercher : Sharpe, Andrew G.; Rechercher : Deek, Jasline; Rechercher : Costamagna, Alejandro C.; Rechercher : Kanamori, Hiroyuki; Rechercher : Kobayashi, Fuminori; Rechercher : Tanaka, Tsuyoshi; Rechercher : Wu, Jianzhong; Rechercher : Handa, Hirokazu; Rechercher : Kuo, Tony; Rechercher : Sese, Jun; Rechercher : Murata, Kazuki; Rechercher : Nabeka, Yusuke; Rechercher : Nasuda, Shuhei; Rechercher : Juliana, Philomin; Rechercher : Singh, Ravi; Rechercher : Budak, Hikmet; Rechercher : Small, Ian; Rechercher : Melonek, Joanna; Rechercher : Cloutier, Sylvie; Rechercher : Keeble-Gagnère, Gabriel; Rechercher : Tibbets, Josquin; Rechercher : Legg, Erik; Rechercher : Bharti, Arvind; Rechercher : Langridge, Peter; Rechercher : Chalmers, Ken; Rechercher : Distelfeld, Assaf; Rechercher : Spannagl, Manuel; Rechercher : Hall, AnthonyIdentifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1806-020X |
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| Affiliation | - Conseil national de recherches Canada. Développement des cultures et des ressources aquatiques
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| Format | Texte, Article |
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| Résumé | Wheat is the most widely cultivated crop in the world, with over 215 million hectares grown annually. The 10+ Wheat Genomes Project recently sequenced and assembled to chromosome-level the genomes of nine wheat cultivars, uncovering genetic diversity and selection within the pan-genome of wheat. Here, we provide a wheat pan-transcriptome with de novo annotation and differential expression analysis for these wheat cultivars across multiple tissues. Using the de novo annotations we identify cultivar-specific genes and define the core and dispensable genomes. Expression analysis across cultivars and tissues reveals conservation in expression between a large core set of homeologous genes, in addition to widespread changes in subgenome homeolog expression bias between cultivars and cultivar-specific expression profiles. We utilise both the newly constructed gene-based wheat pan-genome and pan-transcriptome, demonstrating variation in the prolamin superfamily and immune-reactive proteins across cultivars. |
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| Date de publication | 2025-10-06 |
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| Maison d’édition | Springer Nature |
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| Données connexes | Voir les objets (3) |
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| Langue | anglais |
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| Publications évaluées par des pairs | Oui |
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| Identificateur de l’enregistrement | d7833908-cc57-4d2b-b258-d1b3d365fb36 |
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| Enregistrement créé | 2026-05-15 |
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| Enregistrement modifié | 2026-06-25 |
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