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Transcriptome dissection of candidate genes associated with lentil seed quality traits

Par Conseil national de recherches du Canada

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DOITrouver le DOI : https://doi.org/10.1111/plb.13426
AuteurRechercher : 1Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0003-0874-9078; Rechercher : 1; Rechercher : 1; Rechercher : 1; Rechercher : 1; Rechercher : 1; Rechercher : 1; Rechercher : 1
ÉditeurRechercher : Roach, T.
Affiliation
  1. Conseil national de recherches du Canada. Développement des cultures et des ressources aquatiques
FormatTexte, Article
SujetLens culinaris; lentil breeding; molecular roadmap; seed development; transcriptome
Résumé
Lentils provide a rich plant-based protein source and staple food in many parts of the world. Despite numerous nutritional benefits, lentil seeds also possess undesirable elements, such as anti-nutritional factors. Understanding the genetic networks of seed metabolism is of great importance for improving the seed nutritional profile. We applied RNA sequencing analysis to survey the transcriptome of developing lentil seeds and compared this with that of the pod shells and leaves. In total, we identified 2622 genes differentially expressed among the tissues examined. Genes preferentially expressed in seeds were enriched in the Gene Ontology (GO) terms associated with development, nitrogen and carbon (N/C) metabolism and lipid synthesis. We further categorized seed preferentially expressed genes based on their involvement in storage protein production, starch accumulation, lipid and suberin metabolism, phytate, saponin and phenylpropanoid biosynthesis. The availability of transcript profile datasets on lentil seed metabolism and a roadmap of candidate genes presented here will be of great value for breeding strategies towards further improvement of lentil seed quality traits.
Date de publication
Maison d’éditionWiley
German Society for Plant Sciences
Royal Botanical Society of the Netherlands
Dans
  • Plant Biology 24, nº 5 (août 2022) : 815–826.
Langueanglais
Publications évaluées par des pairsOui
Numéro du CNRCNRC-ACRD-PDB0116
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Identificateur de l’enregistrement8da29359-44ef-43e0-96f9-16764d68e4dc
Enregistrement créé2022-06-03
Enregistrement modifié2022-10-19
Date de modification :