Single-cell amplified genomes of two uncultivated members of the deltaproteobacterial SEEP-SRB1 clade, isolated from marine sediment

DOI	Trouver le DOI : https://doi.org/10.1016/j.margen.2019.01.004
Auteur	Rechercher : Petro, Caitlin; Rechercher : Jochum, Lara M.; Rechercher : Schreiber, Lars¹; Rechercher : Marshall, Ian P.G.; Rechercher : Schramm, Andreas; Rechercher : Kjeldsen, Kasper U.
Affiliation	Conseil national de recherches Canada. Énergie, les mines et l'environnement
Format	Texte, Article
Sujet	single-cell genomics; SAGSEEP-SRB; sulfate-reducing bacteria; hydrocarbon degradation
Résumé	The SEEP-SRB1 is a diverse clade of sulfate reducing bacteria affiliated with the deltaproteobacterial family Desulfobacteraceae. Here we report the draft genome sequences of two single cells belonging to the SEEP-SRB1 clade, isolated from marine sediment in Aarhus Bay, Denmark, by fluorescence activated cell sorting (FACS). The draft genomes measure 2.12 Mb and 0.46 Mb, with GC contents of 45% and 42%. Phylogenetic placement of the 16S rRNA genes places the SAGs within the subgroups SEEP-SRB1e and SEEP-SRB1d. While these subgroups are thought to play a role in non-methane hydrocarbon degradation, there is little genomic information available to confirm their metabolic function. As such, these novel single-cell amplified genomes provide valuable insight into the metabolic potential of this prevalent subseafloor clade.
Date de publication	2019-01-25
Maison d’édition	Elsevier
Dans	Marine Genomics 46 (août 2019) : 66–69.
Langue	anglais
Publications évaluées par des pairs	Oui
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Identificateur de l’enregistrement	541e0ec5-1ef3-4280-9949-60eb70df2c78
Enregistrement créé	2021-08-25
Enregistrement modifié	2021-08-25

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Par :

Conseil national de recherches Canada

Date de modification :: 2026-08-10