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Target sequence specificity of transposon Tn5 in the absence of major hotspots in the plasmid pBR322: identification of a new hotspot

Par Conseil national de recherches du Canada

DOITrouver le DOI : https://doi.org/10.1006/plas.1993.1043
AuteurRechercher : ; Rechercher : 1; Rechercher : 1
Affiliation
  1. Conseil national de recherches du Canada. Institut de biotechnologie des plantes du CNRC
FormatTexte, Article
Résumé
The plasmid pLB11-1 is a pBR322 derivative in which part of the tetracycline resistance (tet) gene (basepair coordinates 23 to 375), containing five hotspots for Tn5 insertion (D. E. Berg et al., Genetics105, 813-828, 1983), has been replaced with a 5.1-kb fragment of Escherichia coli genomic DNA encoding an osmoregulatory function. Restriction mapping of 40 pLB11-1::Tn5 derivatives, chosen at random from 240 Tn5 insertion derivatives with an unaltered osmotolerant phenotype, placed Tn5 in the vector portion of 20 clones. The majority of these insertions (16/20) were located in a 0.09-kb region immediately downstream of the β-lactamase (bla) gene. Nucleotide (nt) sequence analysis of seven insertions from this group revealed an identical site of insertion within pBR322, representing a hitherto unidentified hotspot for Tn₅ insertion. The target sequence, 5′-GTCTGACGC, was found to be duplicated in these cases.
Date de publication
Maison d’éditionElsevier
Dans
  • Plasmid 30, nº 2 (septembre 1993) : 155–158.
Langueanglais
Publications évaluées par des pairsOui
IdentificateurS0147619X83710437
NRCC-36487
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Identificateur de l’enregistrement1b828d7a-91ce-458e-9476-84565ccf7829
Enregistrement créé2023-11-06
Enregistrement modifié2023-11-06
Date de modification :