| Téléchargement | - Voir le manuscrit accepté : Exploring protein architecture using 3d shape-based signatures (PDF, 320 Kio)
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| Auteur | Rechercher : Paquet, Eric; Rechercher : Viktor, H.L. |
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| Format | Texte, Article |
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| Conférence | The 29th Annual International Conference of the IEEE Engineering in medicine and Biology Society (ECMB) in Conjunction with the Biennial Conference of the French Society of Biological and Medical Engineering (SFGBM), August 2007 |
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| Résumé | Envisageons un scénario dans lequel on a identifié une protéine particulière comme étant un composant essentiel et bénéfique d'un médicament sous prescription conçu pour traiter une maladie mortelle. Il y a toutefois des contre-indications à cette protéine et elle provoque des effets indésirables graves dans un certain sous-ensemble de la population. Si on peut trouver une autre protéine de la même famille, disposant d'une structure et de fonctions semblables mais sans les effets indésirables, la modification subséquente du médicament présente des avantages indéniables. Cet article décrit un nouveau système d'indexation et de recherche de similarités permettant de trouver de tels membres d'une famille de structures de protéines en se basant sur leur forme tridimensionnelle. Notre approche est indifférente à la translation, la taille et la rotation, ce qui élimine le besoin de recourir à un alignement préliminaire des structures. Notre évaluation expérimentale qui a porté sur sept (7) familles de protéines différentes indique que notre système localise avec exactitude et précision tous les membres d'une famille. Nous illustrons cette affirmation en montrant que notre système récupère avec précision les membres de l'hémoglobine de l'Homo Sapiens dans une base de données contenant 26 000 structures de protéines. |
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| Date de publication | 2007 |
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| Langue | anglais |
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| Numéro du CNRC | NRCC 49828 |
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| Numéro NPARC | 5764289 |
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| Identificateur de l’enregistrement | 158497cb-0c3a-4efd-8d7e-1de6226d2aed |
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| Enregistrement créé | 2009-03-29 |
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| Enregistrement modifié | 2020-08-12 |
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