Résumé | L’ADN génomique de neuf bactéries, isolées d’un consortium d’un biofilm dégradant le méthyldiclofop, a été extrait pour fin de caractérisation génétique. Les métabolites produits par le consortium lors de la dégradation du méthyldiclofop sont des intermédiaires ou des substrats de bactéries dégradant des composés chlorés. Conséquemment, des amorces oligonucléotidiques, spécifiques pour des gènes cataboliques impliqués dans la dégradation de composés chlorés, ont été testées par PCR pour déterminer l’implication de ces gènes dans la dégradation de méthyldiclofop. L’homologie existant entre les produits de PCR et les gènes étudiés, évaluée par séquençage et transfert de Southern, suggère l’existence de nouveaux gènes cataboliques au sein du consortium. Suite au séquençage de l’ADNr16S et à l’identification des isolats, deux oligonucléotides fluorescents, spécifiques pour deux isolats, ont été utilisées avec succès dans des études d’hybridation in situ en fluorescence (FISH) de ces deux isolats du consortium dans le biofilm. |
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