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| DOI | Trouver le DOI : https://doi.org/10.1016/j.celrep.2025.116785 |
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| Auteur | Rechercher : Halstead-Nussloch, Gwyneth; Rechercher : Okada, Moeko; Rechercher : Haberer, Georg; Rechercher : Lux, Thomas; Rechercher : Islam, A.S.M. Faridul; Rechercher : Hatakeyama, Masaomi; Rechercher : Briskine, Roman; Rechercher : White, Benjamen; Rechercher : Hall, Anthony; Rechercher : Pozniak, Curtis; Rechercher : Walkowiak, Sean; Rechercher : Klymiuk, Valentyna; Rechercher : Byrns, Brook; Rechercher : Nilsen, Kirby; Rechercher : Ens, Jennifer; Rechercher : Wiebe, Krystalee; Rechercher : Diaye, Amidou N’; Rechercher : Hucl, Pierre J.; Rechercher : Pozniak, Curtis; Rechercher : Fu, Bin Xiao; Rechercher : Gao, Liangliang; Rechercher : Delorean, Emily; Rechercher : Koo, Dal-Hoe; Rechercher : Fritz, Allen K.; Rechercher : Poland, Jesse A.; Rechercher : Monat, Cecile; Rechercher : Himmelbach, Axel; Rechercher : Fiebig, Anne; Rechercher : Padmarasu, Sudharsan; Rechercher : Scholz, Uwe; Rechercher : Mascher, Martin; Rechercher : Stein, Nils; Rechercher : Haberer, Georg; Rechercher : Gundlach, Heidrun; Rechercher : Mayer, Klaus F.X.; Rechercher : Spannagl, Manuel; Rechercher : Kassa, Mulualem T.; Rechercher : Fobert, Pierre; Rechercher : Kagale, Sateesh1Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7213-1590; Rechercher : Brinton, Jemima; Rechercher : Ramirez-Gonzalez, Ricardo H.; Rechercher : Bevan, Michael; Rechercher : McKenzie, Neil; Rechercher : Steuernagel, Burkhard; Rechercher : Uauy, Cristobal; Rechercher : Kolodziej, Markus C.; Rechercher : Krattinger, Simon G.; Rechercher : Keller, Beat; Rechercher : Wicker, Thomas; Rechercher : Thambugala, Dinushika; Rechercher : McCartney, Curt A.; Rechercher : Bandi, Venkat; Rechercher : Siri, Jorge Nunez; Rechercher : Gutwin, Carl; Rechercher : Aquino, Catharine; Rechercher : Hatakeyama, Masaomi; Rechercher : Copetti, Dario; Rechercher : Halstead-Nussloch, Gwyneth; Rechercher : Paape, Timothy; Rechercher : Shimizu-Inatsugi, Rie; Rechercher : Shimizu, Kentaro K.; Rechercher : Ban, Tomohiro; Rechercher : Kawaura, Kanako; Rechercher : Tameshige, Toshiaki; Rechercher : Tsuji, Hiroyuki; Rechercher : Venturini, Luca; Rechercher : Clark, Matthew; Rechercher : Fosker, Christine; Rechercher : Accinelli, Gonzalo Garcia; Rechercher : Heavens, Darren; Rechercher : Krasileva, Ksenia; Rechercher : Swarbreck, David; Rechercher : Wright, Jonathan; Rechercher : Hall, Anthony; Rechercher : Gardner, Keith A.; Rechercher : Fradgley, Nick; Rechercher : Percival-Alwyn, Lawrence; Rechercher : Cockram, James; Rechercher : Gutierrez-Gonzalez, Juan; Rechercher : Muehlbauer, Gary; Rechercher : Koh, Chu Shin; Rechercher : Sharpe, Andrew G.; Rechercher : Deek, Jasline; Rechercher : Costamagna, Alejandro C.; Rechercher : Kanamori, Hiroyuki; Rechercher : Kobayashi, Fuminori; Rechercher : Tanaka, Tsuyoshi; Rechercher : Wu, Jianzhong; Rechercher : Handa, Hirokazu; Rechercher : Kuo, Tony; Rechercher : Sese, Jun; Rechercher : Murata, Kazuki; Rechercher : Nabeka, Yusuke; Rechercher : Nasuda, Shuhei; Rechercher : Juliana, Philomin; Rechercher : Singh, Ravi; Rechercher : Budak, Hikmet; Rechercher : Small, Ian; Rechercher : Melonek, Joanna; Rechercher : Cloutier, Sylvie; Rechercher : Keeble-Gagnère, Gabriel; Rechercher : Tibbets, Josquin; Rechercher : Legg, Erik; Rechercher : Bharti, Arvind; Rechercher : Langridge, Peter; Rechercher : Distelfeld, Assaf; Rechercher : Spannagl, Manuel; Rechercher : Paape, Timothy; Rechercher : Shimizu, Kentaro K.Identifiant ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6483-1781; Rechercher : BernardoClavijo; Rechercher : KenChalmers |
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| Affiliation | - Conseil national de recherches Canada. Développement des cultures et des ressources aquatiques
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| Bailleur de fonds | Rechercher : Japan Society for the Promotion of Science; Rechercher : University of Zurich; Rechercher : Core Research for Evolutional Science and Technology; Rechercher : Swiss National Science Foundation; Rechercher : Genome Canada; Rechercher : Western Grains Research Foundation; Rechercher : Manitoba Crop Alliance; Rechercher : Japan Science and Technology Agency; Rechercher : Saskatchewan Wheat Development Commission; Rechercher : Genome Prairie; Rechercher : Saskatchewan Ministry of Agriculture |
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| Format | Texte, Article |
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| Sujet | wheat; genome; transcriptome; purifying selection; subgenome; allohexaploid; evolution |
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| Résumé | The genome-wide pattern of purifying selection on deleterious variants has attracted broad interest in breeding and evolutionary biology. Little is known about purifying selection in polyploid species with potential functional redundancy of duplicated homoeologs. Here, we examine the pattern of polymorphisms and the combined effects of both subgenome and gene expression on estimates of purifying selection in the allohexaploid bread wheat. We utilize the de novo annotated assemblies and transcriptome data of the 10+ Wheat Genome Project. Purifying selection is detected after filtering chromosomes harboring segregating foreign introgression by modern breeding. Interestingly, strong purifying selection is observed in the category of genes that are highly expressed in root tissues and are in the D subgenome, which is thought to contribute to the range expansion after allopolyploidization. We suggest that the combination of expressed tissues and subgenomes will inform the target of future wheat breeding to mitigate the effect of deleterious variants. |
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| Date de publication | 2026-02-24 |
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| Maison d’édition | Elsevier B.V. |
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| Déclaration de droit d’auteur | - © 2025 The Author(s). Published by Elsevier Inc.
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| Dans | |
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| Langue | anglais |
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| Publications évaluées par des pairs | Oui |
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| Identificateur | S2211124725015578 |
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| Exporter la notice | Exporter en format RIS |
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| Identificateur de l’enregistrement | 01735de3-a30e-4de3-9b45-d1cfa61ee9ff |
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| Enregistrement créé | 2026-06-26 |
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| Enregistrement modifié | 2026-07-16 |
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